事发后，乘客被引导下飞机，在丽江机场等待。“丽江机场的工作人员很尽责，给我们送来吃的喝的，尽力安抚大家”，该乘客说，后来乘客们被告知去酒店休息。
 
南航航班信息显示，该航班计划起飞时间为6月9日17:55，实际起飞时间为6月10日1:35。实际起飞时间延误7小时40分钟。航班信息平台Variflight显示，航班延误原因是“天气原因”；10日凌晨，上述旅客收到的航空公司短信也称是天气原因导致航班延误；大众网·海报新闻记者致电南方航空公司，客服工作人员也称航班延误是天气原因。然而，记者致电丽江机场询问该航班延误原因时，工作人员称“CZ3488航班延误是（航空）公司原因，机械故障。”